 |
紐約2022年9月13日 /美通社/ -- 總部位於紐約的生物技術和癌症藥物發現公司 DarwinHealth, Inc. (www.DarwinHealth.com) 宣佈 Current Protocols (Wiley Science) 於 2022 年 9 月 9 日在網上刊登其專有的癌症藥物發現和驗證管道，即「患者到模型到患者 (PMP) 癌症藥物和生物標記發現方案，用於識別和驗證標靶腫瘤調節結構的治療劑」。
文章載於：https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cpz1.544
正如科學家在刊物中指出，代表 DarwinHealth 的基礎藥物、生物標記和新型癌症標靶發現管道／技術的患者到模型到患者 (PMP) 方案，可直接解決當前癌症藥物開發的致命弱點，即無法在人體試驗中成功發現和驗證藥物所需的三個關鍵要素之間建立精確和可預測的聯繫，包括：(a) 確定癌細胞狀態的機制生物學驅動因素和決定因素；(b) 表徵和標靶控制癌細胞轉錄狀態的具有治療意義的分子標靶；以及 (c) 產生經過驗證的生物標記，以便準確預測試驗環境中的臨床反應。
癌症的異質性使這些基於精確的癌症治療和藥物發現障礙變得更複雜，DarwinHealth 集團透過將單細胞分析與專有演算法工具結合來解決這挑戰，從而可以根據其轉錄身份狀態對腫瘤亞型進行分類。
利用基於腫瘤結構的癌症生物學框架，DarwinHealth 報告的 PMP 方法採用運算演算法和實驗方法來重建與詢問人類癌細胞的調節邏輯，用全新和現有的藥劑識別和治療標靶「腫瘤檢查點」。重要的是，PMP 方案從特定的患者腫瘤樣本以系統方法識別構成腫瘤檢查點的主調節因子 (MR) 蛋白。然後，使用基因表達譜（RNA 測序）識別體外和體內模型，透過概括患者的腫瘤檢查點，構成適當的細胞系和動物模型，以進一步闡明組織環境特異性藥物的作用機制。
使用這些匹配模型可以對藥物功效進行精確、基於生物標記的臨床前驗證，然後可以將其結果轉為更先進的 PDX 驗證和人體試驗，而目前正在使用此技術進行。具體而言，藥物特定背景的作用機制和患者腫瘤檢查點的精確識別結合，為患者最有可能對正在研究的藥物治療產生反應，提供一種個人化、基於機制的生物標記，使前瞻性臨床試驗獲得更豐富資訊。
科學記者 Forest Ray 博士解釋了 DarwinHealth 的 PMP 藥物和生物標記發現平台的科學和商業影響，在 genomeweb 發表的一篇網上文章中報告該論文及其技術。文章載於：
主要作者兼 DarwinHealth 運算生物學高級總監 Pasquale Laise 博士表示：「PMP 是一種以患者為中心、系統生物學驅動的方案。它整合高度複雜的運算方法和實驗方法，即結合單細胞分析的精度，以優化和加速藥物發現 。雖然方案是完全可普及，並且可以應用於任何癌症類型或亞型，但 PMP 發現管道的每一步都是針對個人患者樣本中腫瘤的分子譜量身定制。因此，它還能識別代表與機械生物標記相關的不同藥型的大量患者，這種排列可以在最大程度上提高生物標記導向臨床試驗的成功機會。」
腫瘤檢查點的識別和基於藥物的標靶是 DarwinHealth 專注於癌症藥物開發的專有方法標誌。DarwinHealth 科學總監 Mariano Alvarez 博士解釋：「PMP 方案構成一種系統方法，用於識別和標靶控制癌細胞轉錄身份（表型狀態）的核心調節蛋白（或主調節因子），這使得此 Compound-2-Clinic (C2C) 發展路線圖有別於所有其他可用的策略 。重要的是，它將癌基因成癮的概念擴展到癌細胞狀態的轉錄調節因子，這些調節因子普遍存在，因此可以針對每個腫瘤進行解剖。方案透過直接從患者的腫瘤組織中分離出此類主調節劑，然後透過使用藥物的環境特定作用機制來關閉循環，即在相關的體外模型中得到經驗性闡明，該管道可預測正在評估的藥物在最重要的環境中的治療反應：臨床試驗。」
PMP 方案旨在解決當前癌症治療和生物標記開發方法的不足和限制。哥倫比亞大學系統生物學系教授兼系主任 (https://news.columbia.edu/news/deciphering-cancer-messy-and-complex-were-here-it) 暨 DarwinHealth 聯合創辦人 Andrea Califano 解釋：「就如同一座興建在多根柱上的建築物，需要注意的是，損害任何一根柱都不會導致整個結構倒塌，而癌症治療的最佳、持久方法需要同時針對多個腫瘤依賴性。本手稿中強調的癌症藥物發現的技術和方法，透過標靶整個腫瘤脆弱性庫，為癌基因治療提供顯著的互補作用，以負責維持異常狀態和腫瘤細胞調節程序的主調節蛋白為代表。」
DarwinHealth 的 PMP 平台和藥物發現管道鞏固了公司為許多科學合作和夥伴關係部署的基礎技術，專注於識別新的癌症標靶、產生新的生物標記和藥物開發。DarwinHealth 聯合創辦人兼行政總裁 Gideon Bosker 解釋：「我們報告的患者到模型到患者方案 (PMP) 是一種以患者腫瘤樣本為中心、基於系統生物學的癌症藥物發現管道，在精準腫瘤學和免疫腫瘤學領域廣泛應用 。Current Protocols 中報告的化合物到臨床藥物開發和驗證流程的每一步都透過運算演算法和實驗數據整合來確保標靶調節結構，即『腫瘤檢查點』。隨著方案從細胞系發展至動物模型，最後進入患者的臨床轉化，受評估藥物的作用機制 (MOA) 始終保持可操作的連繫。它在癌症生物學背景下的普遍性允許 PMP 模型應用於廣泛的血液和實體腫瘤，目前正在進行大量基於這種藥物發現技術的臨床試驗。此外，在腫瘤微環境中應用 PMP 技術優化免疫反應和減少細胞亞型（包括 Tregs、成纖維細胞和巨噬細胞）之間的免疫抑制作用，代表了透過重新編程免疫抑制細胞的表型狀態，是開發可挽救免疫檢查點抑制劑反應的藥物的最有希望軌跡之一。」
當以系統方式部署時，就像在 DarwinHealth 中一樣，PMP 方案的商業應用正在不斷完善和擴展，基於 PMP 的癌症標靶、生物標記和藥物發現管道，提供了一個路線圖，用於基於精確和作用機制識別標靶腫瘤調節結構，以及以免疫為中心的細胞調節結構的研究性、專有和經美國食品及藥物管理局 (FDA) 批准的治療劑。
關於 DarwinHealth
DarwinHealth: Precision Therapeutics for Cancer Medicine 是一家專注於「癌症前沿」生物技術的公司，由行政總裁 Gideon Bosker 醫學博士、Andrea Califano 教授（哥倫比亞大學系統生物學系化學系統生物學 Clyde 及 Helen Wu 教授兼主席）共同創立。公司的技術是由 Califano 實驗室在過去 15 年中開發，並獲得了哥倫比亞大學的獨家許可。
DarwinHealth 利用專有的系統生物學演算法將幾乎每位癌症患者與最有可能產生成功治療結果的藥物和藥物組合匹配。Bosker 醫生解釋：「相反，這些相同的演算法也可以優先考慮針對潛在人體惡性腫瘤以及新型癌症標靶的未知潛力的研究藥物和化合物組合， 這對於尋求優化化合物管道並發現具有機械作用的新型癌症標靶和化合物-腫瘤比對的製藥公司而言，它們是無價的。」
DarwinHealth 的使命宣言是部署植根於系統生物學的新技術，以改善癌症治療的臨床結果。它的核心技術 VIPER 演算法可以識別主調節蛋白的緊密結合模組，這些蛋白代表了癌症中一類新的可作用的治療標靶。該方法在兩個互補的方面得到應用：首先，DarwinHealth 的技術支援在更基本、更深入的癌細胞調節邏輯狀態下系統性識別和驗證可藥物化標靶，因此，我們和科學合作夥伴可以基於基本和更普遍的腫瘤依賴性和機制來利用下一代的可操作性。其次，從藥物開發和發現的角度來看，相同的技術能夠基於主調節劑和這些標靶的上游調節劑來識別潛在可藥物治療的新型標靶。這就是 DarwinHealth 直腸癌方法的重點，它著重於闡明和以腫瘤檢查點作為標靶，提供了最重要的解決方案和重新定位路線圖，以推進以精準為重點的癌症藥物發現和治療。
DarwinHealth 所採用的專有、基於精確醫學的方法得到其科學領導者撰寫的大量科學文獻支援，其中包括共同開發公司關鍵計算基礎設施的 DarwinHealth 科學總監 Mariano Alvarez 博士。這些專有策略透過整合電腦、體外和體內的數據，利用逆向工程和分析癌細胞的全基因組調節和訊號邏輯的能力。 這提供了一個完全整合的藥物表徵和發現平台，旨在闡明、加速和驗證藥物資產的精確發展軌跡，因此可以充分發揮其臨床和商業潛力。如欲了解更多資訊，請瀏覽：www.DarwinHealth.com。
