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【サンディエゴ2022年8月30日PR Newswire】
＊新たなパートナーシップにより、ハイスループット・シーケンス・パワーを使った、従来の調査手法を上回るスピードでの海洋生物の測定、理解が可能に
Minderoo Foundationとイルミナ（Illumina, Inc.）（NASDAQ: ILMN）は19日、4000万オーストラリア・ドル（2780万米ドル）のパートナーシップを締結し、ゲノミクスの力を活用して海洋生態系の科学的理解を促し、海洋保護活動家が十分な情報に基づいた意思決定を行えるようにすると発表した。この3年間のパートナーシップは、海洋の生物多様性保全と、人々や各国経済がよって立つ海洋生態系の変化の理解に対するコミットメントの共有を示すものである。
Minderoo Foundationのオーシャノミクス部長、Steve Burnell博士は、環境DNA（eDNA）技術を拡大し、新たな計算法や人工知能を活用したアプローチを採用すれば、海洋生物に対する理解とそれを保護する能力に革命的変化をもたらす可能性があると語った。
Burnell氏は「本研究は、絶滅の危機に瀕している種や外来種あるいはこれまで理解が不十分だった可能性のある種を迅速に特定することで、タイムリーかつインパクトのある海洋生物多様性保全に役立つデータや情報に寄与できるだろう。Minderoo Foundationは、海洋を豊かな状態に戻すことに全力で取り組んでいる」と語った。
eDNAを使った海洋生態系の監視は、科学者が生物多様性を理解し、変化を測定する際の解像度や感度を高めることができる。コップ1杯の海水には数百万個のeDNAや細胞が含まれており、そこに存在する生物の寸評、さらにはその個体数や健康状態に関する情報が得られる可能性がある。しかし、一般的な海水サンプルでは、回収されるDNA配列の98％以上が海洋微生物のものである。今回のパートナーシップにより、ヒューマンヘルス産業におけるイノベーションが、こうした複雑な海水サンプルから海産脊椎動物に特有の配列情報を抽出するために活用されることになる。
両パートナーは、海水中の未知のeDNA配列の同定を可能にするため、既知の海洋脊椎動物からハイスループットのゲノム配列を作成する研究開発プロジェクトにも取り組む。海洋脊椎動物のゲノムは、既知の約2万1000種のうち1％しか解読されていないため、主な目的の1つは、博物館が所蔵する豊富なサンプルからの参照ゲノム配列の作成である。
今回の広範な研究開発パートナーシップの一環として、Minderoo Foundationは、イルミナの最先端のハイスループット・ベンチトップ型DNAシーケンサー「NextSeq（TM）2000」シーケンスシステムを調査船に搭載した。
イルミナのGretchen Weightmanグローバル商業戦略責任者兼アジア太平洋・日本部長は、NextSeq 2000をMinderooの調査船に直接搭載することで、両パートナーは海上での真のハイスループット・シーケンスを初めて実証し、海水サンプルから質の高いシーケンスデータまで、数時間で海洋遺伝情報をほぼリアルタイムで作成できるようになった、と語った。
Weightman氏は「イルミナの先端技術のお陰で、研究者は重要データを収集し、商業漁業と保護要件を考慮した上で、世界の海洋管理方法が及ぼす影響の重要性について理解を深めることができるだろう」と語った。
▽Minderoo Foundationについて
2001年にAndrew Forrest、Nicola Forrestの両氏によって設立されたMinderoo Foundationは、障壁を取り除き、革新し、前向きかつ持続的な変化の推進を目指す現代的慈善団体である。Minderoo Foundationは、オーストラリアの団体であることに誇りを持ち、海洋保護や奴隷制廃止から、がん撲滅に向けた協力やコミュニティープロジェクトづくりまで、幅広い重要活動に取り組んでいる。詳細については、https://www.minderoo.org/ を参照し、Twitter、Facebook、LinkedIn、Instagram、Vimeoで連絡を。
▽イルミナ（Illumina）について
イルミナは、ゲノムの力を解き放つことで、人々の健康を向上させている。当社は、イノベーションに注力することで、DNAシーケンシングとアレイベース技術のグローバルリーダーの地位を確立し、研究、臨床、および応用市場の顧客にサービスを提供している。当社の製品は、ライフサイエンス、腫瘍学、リプロダクティブ・ヘルス、農業、その他の新興分野でさまざまな用途に使われている。詳細については、https://www.illumina.com/ を参照し、Twitter、Facebook、LinkedIn、Instagram、YouTubeで連絡を。
ソース：Illumina
